A Universidade conta com o apoio de prestigiadas instituições em diferentes áreas:
Agricultura
- Centro Cooperativo Sueco/Programa de Apoio à Sociedade Civil no Niassa e à Faculdade de Agricultura da UCM
- Dronten Agricultural College: parceria para a área de Agricultura
- MISEREOR – projectos de desenvolvimento rural na Faculdade de Agricultura (Cuamba)
- Regional Universities Forum for Capacity Building in Agriculture (RUFORUM): parceria com a área de Agricultura (Cuamba)
Docência
- Centrum fur Internationale Migration und Entwicklung (Centro para Migração e Desenvolvimento): parceria para a colocação de peritos integrados na UCM
- Cooperação Catalã: envio de médicos para leccionação na Faculdade de Ciências de Saúde
- CUAMM: envio de médicos para a Faculdade de Ciências de Saúde
- Organização Austríaca de Cooperação ao Desenvolvimento (Horizont3000): parceria para colocação de peritos integrados (assistência técnica) na UCM
- Skillshare International (Reino Unido): envio de docentes para várias áreas
- Universidade de Aveiro: parceria para a promoção de intercâmbios de docentes ou especialistas (realização de cursos intensivos, seminários, ciclos de conferências…).
- Universidade do Minho (Portugal): parceria para a promoção de intercâmbios de docentes ou especialistas (realização de cursos intensivos, seminários, ciclos de conferências)
Formação, investigação e pesquisa
- Amsterdam Medical Center (Holanda): pesquisa no CIDI li>Embaixada dos Estados Unidos em Moçambique: bolsas de estudo para estudantes do curso de Medicina
- Family Health International (FHI) – projectos de pesquisa no CIDI
- Intermón Oxfam
- Partnership for Higher Education in Africa (PHEA): programa de capacity building no CED
- Universidade de Pittsburgh - Twinning Project - Centro de Saúde S. Lucas da FCS.
- Pontifícia Universidade Católica de Goiás: programas conjuntos de formação, pesquisa, extensão e mobilidade de estudantes
- Universidade da Beira Interior (Portugal): área de formação e pesquisa
- Universidade de Aveiro (Portugal): programas conjuntos de investigação e desenvolvimento nos domínios considerados de interesse comum
- Universidade de La Sabana (Colombia): programas de formação
- Universidade de Maastricht (Países Baixos): PBL e programas de formação
- Universidade de Trás-Os-Montes e Alto Douro (Portugal): pareceria para a área de formação, actividades de pesquisa, extensão e consultorias
- Universidade do Minho (Portugal): programas conjuntos de investigação e desenvolvimento nos domínios considerados de interesse comum
- Università degli Studi – Bologna (Itália): parceria com a UCM – Faculade de Educação e Comunicação (Nampula)
- University of Johannesburg (Africa do Sul): parceria para a área de formação e pesquisa
- University of Pretoria (Africa do Sul): parceria para a área de formação e ensino à distância
- West Virginia Morgantown University (EUA): programas de formação e de desenvolvimento institucional. Infra-estruturas
- Conferência Episcopal Italiana: projectos de reabilitação de infra-estruturas nas várias Faculdades
- MISEREOR e Patriarcado de Lisboa – projecto de construção de casas para docentes da Faculdade de Ciências de Saúde (Beira) Mestrados e Doutoramentos
- Universidade Católica Portuguesa: Mestrado conjunto em Ciência Política, Governação e Relações Internacionais (IEP/UCP-UCM) e Doutoramento na FEC
- Universidade Nova de Lisboa: Mestrado SUGIK com GIS
- Universidade Pública de Navarra: Mestrado em Ciências Agrárias e programas de formação na área de Engenharia Alimentar
- Zimbabwe Open University: Doutoramento em Ciências Económicas Saúde Alemanha
- Center for International Health da Universidade de Munich (Ludwig-Maximillian-Universitaet)
- Deustche Gesellschaft fur Technische Zusammerbeit GTZ-DED: Programa Multisectorial do Combate ao HIV/SIDA
- Dioceses: Munich, Stuttgard, Rotenburg, Freising, Augsburg, Eichstaett e Missio
- EED
- Embaixada Bélgica
- Universidade de Gent: Saúde Familiar e Comunitária Espanha
- Agência Catalã de Desenvolvimento Estados Unidos de América
- CDC
- Embaixada
- Fogaty Foundation
- Ford Foundation
- Pittsburg University: Centro de Saúde S. Lucas
- Twinning Center
- University of West Virginia Holanda
- Academic medical Center of the University of Amsterdam
- DERMOSAM
- Doctors for Mozambique
- Rotary Club
- University of Maastricht Itália
- Conferência Episcopal Itália
- Cooperação Italiana
- CUAMM
- Institutos Hospitaleiros de Cremona: projecto de cooperação internacional no âmbito da saúde Inglaterra
- Ipswich – Beira – Health – Initiative
- Skillshare
- VSO Moçambique
- Direcção Provincial de Saúde
- Hospital Central da Beira
- Ministério de Saúde
- Rotary Club da Beira
- Vodacom Moçambique Portugal
- Universidade Beira Interior
- Universidade Católica de Portugal

